Siêu vi viêm gan C (HCV) là virút chứa ARN, nhỏ, chuỗi đơn dương có vỏ bọc.[5] HCV thuộc chi hepacivirus, họ Flaviviridae.[11] HCV có 7 kiểu gen (genotype) chính, biểu thị bằng số từ 1 đến 7.[19] Ở Mỹ, có khoảng 70% số ca viêm gan siêu vi C do genotype 1, có 20% ca do genotype 2, và khoảng 1% do mỗi trong số các genotype còn lại gây ra.[7] Genotype 1 cũng là loại gây bệnh phổ biến nhất ở Nam Mỹ và châu Âu.[5]